对于林恩来说，查找柯南的位置并不难。
有着黑科技定位神器的他，只要动动手指，就能找出柯南当下的所在地。
但问题是。
他对此前发生的一切都一无所知，自然也就需要工藤夫妇告知他具体的详情。
不然立刻就把柯南给找到，他又该怎么解释这一切呢？
那么时间回到数小时前——
工藤夫妇急匆匆赶回东樱，在发觉自家的儿子已经成功入住毛利家，并以小学生江户川柯南的身份展开了全新生活后，的确让他们长长的松了口气。
可在放松之余，以捉弄儿子为爱好的工藤有希子却突然想要逗逗儿子，便联合丈夫一起，经过一番伪装，以柯南母亲的身份将柯南从毛利家给接走了。
不知真相的柯南自然很慌张，以为遭到绑架的他，开始与父母斗智斗勇。
可就在这场追逐游戏的过程中，本以为掌控着全局的工藤夫妇却发现，这场游戏好像渐渐脱离了他们的控制。
直到最后，当他们发现柯南彻底失踪，再找不到他的踪迹后，才终于发现了情况不对！
在柯南变成小学生后，知道他真实身份的人压根就没两个。