。几位执政大臣最终商议，吴曦叛乱，其罪当诛，从吴曦叛乱的，罪行较大的共有二十六人一率处斩，其余一率流放各地充军服役。但吴曦已死，无法再追究罪行，吴曦的家属全部流放琼州。而其他吴氏家人未吴曦叛乱的一率治罪，未从者不予追究，但夺其官职，并勒令迁出四川，改在其他地方居住。并追夺吴曦的父亲吴挺定江军节度使、太尉、少师、开府仪同三司等官职爵位。但念吴璘功绩绰著，仍然保留他的王爵。
而吴玠一系并未随吴曦反叛，因此都不予追究，子孙的荫恩官职也全都保留，但也要全部迁出四川，另寻居住。吴拱是被吴曦所害，追任少师，越国公，谥号襄烈。同时吴旷和吴晴从杨炎平叛有功，加封吴旷为武翼郎，吴晴为新昌县主，乃在杨炎部下听用，日后如果再立战功，另行封赏。
而其他四川的官员，如王炎仍为四川宣抚使兼任兴元府御前驻军都统制，杨朝光仍为兴州御前驻军都统制，王彦暂任金州御前驻军都统制。其他有功之人，如杨巨源、李好义、杨辅、韩植等人都加升一级。其他虽然从吴曦叛乱，但又投降大宋的，依然保持原有官职。杨炎等人四川平乱的中下级将士也都升官一阶，只有杨炎功绩太大，而且现在以经位居节度使，出任一路招抚使，只能等到