所以，在丰臣秀吉死后。德川家康开始各种搞事情，终于使得以丰臣家保护人，道义守护者自居的石田三成无法忍受，纠集了一批丰臣家臣对德川家康发动战争。起决定意义的一场战役，就是关原之战。
关原之战后，石田三成被斩首，以他为首的丰臣家文治派灰飞烟灭。丰臣家的直辖领地被削减到了80万石，以前对德川家不满的几个实力较大，领地超过百万石的大名，其领地也不同程度的遭到了削减。而德川家康及其亲属的领地，猛增到了六百万石。占全日本总石高的六分之一强。
西元1603年，德川家康进位征夷大将军，成为日本事实上的统治者。
但是，这种统治比起中国的中央集权帝国体制而言，就松散得多了：德川家不过是又一个日本封建领主总盟主而已。虽说这个总盟主比前一任要有力得多，但总盟主之下，各个大名仍然具有高度的独立性。
而且，此时的前一任总盟主丰臣家只是被极大削弱，却没有灭亡。虽说此时的丰臣家表面上石高只有80万石，但是人家有底蕴（丰臣秀吉搂钱的本事一流），有商业（丰臣家的核心大阪，从这个时代起一直到二战初期，都是日本的经济中心），有同情者（丰臣家以前的家臣，在战乱中失