行政管理，由于商贸区内拥有大量的洋人，所以这管理模式肯定不能和传统的中国行政管理模式一样。
为此，林哲参考了后世的一些经验，设置了多个机构！
上海商贸区衙门下设总务处、巡警处、财务处、工商处、司法处等机构
至于洋人司法事务，则是根据南京条约则设立多国法庭，有英国法庭、法国法庭、美国法庭，至于那些尚未和中国有条约，没有司法自治权的其他国家商人在商贸区的犯罪行为，则是由司法处直接管理。
这些机构的设立严格上来说并不算中国的传统官方机构，他只是林哲这个督办的私属个人机构，朝廷只委任了一个督办，至于林哲这个督办怎么管辖商贸区，怎么和洋人打交道，那是林哲的事。
此外林哲的头衔并不是说商贸区区长，多少品之类的，而只是一个督办，只是一个临时差遣而已，不是什么实职。
简单来说，和他以前的诸多头衔差不多，都是临时性的，不具备传统的官员性质。
不过这也好，给予了他极大的自主权以处理商贸区内的事务。
对于这些新设机构的负责人，林哲一时间也找不到多少合格的官员，只能是从自己身边的人里选用，于是乎，毕余同这个余胜军的