珊瑚海海战最终由于自然界的不可抗力被强行拉下帷幕，带着一肚子怨气的中美联合舰队向着北方返回，就双方的战斗损伤来说，美军“列克星敦”号航空母舰被击沉，“约克城”号遭到重创，明尼阿波利斯号、阿斯托尼亚号、波特兰号、澳大利亚号巡洋舰及5艘驱逐舰被日军击沉，还有差不多数字的巡洋舰和驱逐舰负伤，需要返回船坞修整，民国海军方面也有数艘驱逐舰和巡洋舰轻伤，同时损失战斗机60余架，其中只救回了接近6成飞行员，剩下四成不是失踪就是被俘。｛｝
但是他们获得战绩也不俗，击沉日本重型航空母舰一艘，轻型航母一艘，重型巡洋舰5艘，驱逐舰近10艘，摧毁日军补给运输船团三个，击沉日军运输船19艘，总吨位接近十四万，同时中美联合海军舰队还连续炮击、反复轰炸了日军在瓜岛上的日军阵地，让瓜岛上的美国海军陆战队压力骤减，也算是对美国海军陆战队能够守住瓜岛做出了不小的贡献。
当然，最关键的是，被干掉了一艘航母的日军第五航空队哪里还敢在珊瑚海海域继续呆下去，台风一过就奉命北上，离开了中美联合舰队的活动区域，中美联合舰队基本控制了珊瑚海海域，可以说日本人想继续南下攻入澳大利亚的可能性已经随着他们失去