国民革命军重建过程中，还是出现了不少的麻烦，最常见的一点就是前湘军和地方部队之间的冲突，这一次拿到名义的黄炳德在《1940年整军计划》中，明确的点出了，军队是国家所有，不是个人的私兵，所有国民革命军部队必须无条件接受改编，所有中高级军官无条件接受轮换，很多人一开始都以为是黄炳德打算假借这个整军计划，吞并那些中小型军阀，但是没想到的是，之前投靠黄炳德的那些将军，在完成了军校里的短期培训课程之后，一个个出来领兵了，其中不乏几个高级将领直接获得军级部队的指挥权，然后随之而来的就是强力的监管体系的建立，隶属于国名革命军总参谋部的下设军纪处和鉴别课就是负责这方面事情的。｛｝
当然，也不是没有意外发生，自从国民政府迁都武汉，摆出一副极其强硬的要收复失地的架势，加上黄炳德毫不客气的大规模整编部队，高级军官回炉重修，不少军阀倾向严重的高级将领产生了极大的不满，于是在1940年4月份，某位突然出走的国民政府高层，一口气拉走了9个军，合计约40万名****，在南京组织新国民政府，史称汪伪政权，在彼就职典礼上，将黄炳德比作袁世凯，并且也同样立誓，宣称将会为了保护共和，和黄炳德一战到底，同