，但是在战争发生之后直接指挥军队作战，摇身一变成为联合指挥部，指挥陆海军进行决战。指挥总部除了研究各国情报对抗外，还享有其他部门所没有的人事任命权，这一点是指挥总部凌驾于其他部门的最大特点。
情报总部负责人为情报总长辛洛、情报次长高文龙，负责国内外军事情报以及各种间谍活动。辛洛一直以来负责情报，而高文龙则是曹跃留在西北的重要情报负责人，负责保护曹跃的根基甘肃与陕西的情报安全，这一次算是终于出头了，走向了台面上。
宪兵总部负责人为宪兵司令吴殿英、副司令刘冠雄，负责皇家禁卫军军法军纪方面，并负责对外军礼仪形象方面。其中刘冠雄是海军出身，从海军联合舰队司令一跃官升一级成为宪兵总部副司令，这其中的调令耐人寻味了，或许与他当初在东京湾的时候，并没有执行曹跃要求炮击东京的抗命事件有关。
后勤总部负责人为武装司令丛晨，副司令陈开天，负责后勤保障、弹药储备、军事研发、武器生产、军事运输保障、物资调配等各方面内容，是帝国皇家禁卫军的最大依仗，而一直以来受到曹跃新任的丛晨和陈开天两位老兄弟坐镇后勤总部，也彰显了曹跃对后勤的重视程度。此外，后勤总部还兼具军事教育以及