郑成功通过鹿耳门后，来到了赤嵌城，当下军队登陆，包围了赤嵌城荷军，并割断了赤嵌城与台湾城之间的联系。
这时，坐镇赤嵌城的荷军司令官猫难实叮，他仅有兵力约四百人，而龟缩在台湾城中的荷兰侵略军长官揆一，也只有1100人，战舰和小船各两只。
荷军兵力虽弱，但气焰嚣张侵略者狂妄叫嚣“二十五个中国人合在一起还比不上一个荷兰兵”，“只要放一阵排枪，打中其中几个人，他们便会吓得四散逃跑，全部瓦解”。
揆一妄图凭借其船坚炮利和城堡坚固，分三路向郑军实施反扑：一路分战舰向停泊在台江的中国船只进攻，一路由贝德尔上尉率兵240人抵抗从北线尾登陆的郑军，一路由阿尔多普上尉率兵力200名乘船增援赤嵌城。
郑军从禾寮港登陆扎营后，即遭到赤嵌城荷军的炮击。同时，荷军又放火焚烧马厩、粟仓。
郑成功“恐被焚烧粮粟”，派杨英等率军前往看守堵御，接着，郑成功调整了部署：命令左虎卫王大雄、右虎卫陈蟒率领统船控制鹿耳门海口，以便接应第二梯队登陆；令宣教前镇陈泽率兵防守北线尾一带，以保障主力侧后安全，并置台湾城荷军于腹背受敌的境地，另派兵一部监视台江江面，切断