，早有不臣之心，他认为四川官军弱不经战，非常轻视，久欲占据整个四川，独霸一方。
杨应龙的居所，雕龙饰凤，又擅用阉宦，俨然是一个土皇帝。
他为人狡诈多疑，好以诛杀立威，结怨甚深，所辖五司七姓不堪其虐，纷纷叛离。
杨应龙听信宠妾谗言，杀妻及岳母，妻叔张时照向明廷告其谋反。
万历十八年，公元1590年，贵州巡抚叶梦熊也上奏杨应龙不法诸事，力主勘问。
此时，松潘地区动乱不安，播州壮兵不断受调到外地协防，四川巡抚李化龙奏请暂免勘问。
黔蜀两省意见不一。
万历十九年，叶梦熊重议勘问，奏请播州改派流官治理。
李化龙与之相左，遭致怀疑与斥责。
朝廷诏命黔蜀两省会勘，杨应龙当然愿赴蜀而不赴黔。
万历二十年，杨应龙赴渝受审，依法当斩。
这时，恰好倭人进犯朝鲜，杨应龙请求献金赎罪并带兵征倭，朝廷允准。
而四川巡抚王继光坚持严提勘结，杨应龙抗命不出，朝廷下令进剿。
万历二十一年，王继光会兵进剿，抵达娄山关。
杨应龙诈