院同知赫厮、秃赤率阿速军镇压，结果大败而归；不久又派其弟也先帖木儿等率十余万军进兵河南，结果在沙河不战而溃。
脱脱见中央军失败，当下利用各地的地主武装--义兵来镇压起义军，其中以河南沈丘的察罕帖木儿和罗山的李思齐最为凶狠，对中原红巾军威胁最大。
这样一来，勉强扑灭了一些起义军。
至正十二年八月，脱脱决定亲率大军，出征徐州。
起义军的芝麻李占领徐州后，尽有徐州附近州县，徐州地处黄河与运河交汇处，因此红巾军切断了通过漕运对大都的物资供应。
九月，脱脱破徐州，进行了惨无人道的大屠杀，芝麻李被杀。
脱脱班师回朝，妥欢贴睦尔加其为太师，于徐州为脱脱建生祠，立《徐州平寇碑》，以着其功绩。
这时的元顺帝，对脱脱还是寄以希望的。
不过，腐朽的元朝，在面对到处百姓造反的局面时，内部还加紧争权。
想要击败脱脱，争取权力的是中书右丞哈麻。
我每次打哈麻名字的时候，跳出来的，都是蛤蟆两个字。可见，这个哈麻，真是个蛤蟆啊！
国家局势不好的时候，还加紧争权，不以